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小叶楠DNA检测

原创
关键字: 小叶楠DNA测试方法,小叶楠DNA测试范围,小叶楠DNA测试周期
发布时间:2025-07-12 08:42:40
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检测项目

分子标记检测:

  • SSR标记分析:等位基因数≥10、多态性信息含量PIC≥0.5(参照ISFG标准)
  • SNP检测:位点覆盖率≥99%、最小等位基因频率MAF≥0.05
  • InDel变异检测:插入缺失长度1-50bp、检测灵敏度≥95%
序列分析:
  • 叶绿体基因组测序:覆盖长度≥150kb、序列一致性≥98%
  • 核基因测序:深度≥30X、变异检测精度≥99%
  • 线粒体DNA分析:保守区域覆盖率≥95%、突变率≤0.1%
遗传多样性测试:
  • 期望杂合度计算:He≥0.6、观测杂合度Ho偏差±0.1
  • 等位基因丰富度:AR≥5.0、有效等位基因数Ne≥4.0
  • 群体分化指数:Fst值0.05-0.25、基因流Nm≥1.0
物种鉴定:
  • 特异性引物扩增:扩增效率≥90%、产物长度100-500bp
  • 条形码序列比对:相似度≥98%、参考数据库覆盖率100%
  • 叶绿体matK基因分析:变异位点≤3个、鉴定准确率≥99%
亲子关系分析:
  • 亲权指数计算:PI≥99.9%、排除概率≥99.99%
  • 微卫星位点匹配:共享等位基因数≥15、错配率≤1%
  • 单倍型传递验证:传递一致性≥98%、突变检测限0.1%
基因表达量测定:
  • RNA-seq分析:FPKM值≥1.0、差异表达基因检出率≥95%
  • qPCR定量:Ct值≤30、扩增曲线R²≥0.99
  • 转录本组装:N50长度≥1000bp、拼接完整度≥90%
DNA纯度检测:
  • 吸光度比值:OD260/280 1.8-2.0、OD260/230 ≥2.0
  • 凝胶电泳测试:片段完整性≥90%、降解率≤5%
  • 污染物筛查:蛋白质残留≤1μg/mg、多糖含量≤0.5%
定量PCR应用:
  • 拷贝数变异检测:ΔΔCt法精度±0.5、动态范围10^2-10^6
  • 基因表达相对定量:fold change ≥2.0、p值≤0.05
  • 内参基因稳定性:geNorm值≤0.5、Ct值变异系数CV≤5%
甲基化分析:
  • 5-mC含量测定:范围0.5-5%、检测限0.1%
  • BS-seq测序:覆盖深度≥10X、甲基化位点识别率≥95%
  • 差异甲基化区域:DMR大小≥100bp、富集倍数≥2.0
污染源筛查:
  • 微生物DNA检测:含量<1%、物种特异性引物扩增阴性
  • 环境污染物筛查:重金属残留≤1ppm、农药残留≤0.01ppm
  • 交叉污染控制:阴性对照无扩增、阳性对照通过率100%

检测范围

1. 新鲜叶片样本: 采集自活体植株,重点检测DNA提取纯度及物种特异性标记,确保无降解和污染。

2. 干燥木材样本: 来源于加工木材,侧重古DNA残留分析和降解测试,检测片段长度≥100bp。

3. 种子样本: 包括发芽种子,检测遗传多样性指数和亲子关系概率,验证种源真实性。

4. 根组织样本: 取自地下部分,重点分析微生物污染和基因表达差异,筛查根际微生物DNA。

5. 培养细胞样本: 来自组织培养物,检测细胞系稳定性及甲基化水平变化,测试培养过程影响。

6. 环境DNA样本: 提取自土壤或水体,侧重污染物筛查和物种混合鉴定,检测灵敏度≥95%.

7. 古DNA样本: 来源于考古材料,重点测试降解程度及修复效率,确保序列覆盖长度≥50bp。

8. 加工产品样本: 如木制品或提取物,检测残留DNA及污染源,验证成分纯度和来源。

9. 混合样本: 多物种混合材料,侧重SNP分型和遗传分化指数计算,识别小叶楠特异性位点。

10. 标准参考样本: 包括阳性对照品,重点验证检测方法准确性和设备校准,确保结果可重复性。

检测方法

国际标准:

  • ISO 21571:2005 食品中DNA提取方法(采用CTAB法,提取效率≥90%)
  • ISO 20395:2018 高通量测序技术规范(覆盖深度≥30X,误差率≤0.1%)
  • ISFG 2016 亲子鉴定指南(PI计算算法,匹配概率模型)
国家标准:
  • GB/T 5009.124-2003 植物源性食品DNA检测方法(提取纯度要求OD260/280 1.8-2.0)
  • GB/T 30992-2014 基因测序技术规范(序列比对相似度≥98%,差异位点报告)
  • GB/T 3543.5-1995 农作物种子检验规程(发芽率关联DNA完整性检测)
方法差异说明:ISO标准侧重高通量流程,GB标准强调提取纯度控制;ISO测序深度要求更高,GB则注重成本优化;亲子分析中ISFG使用贝叶斯模型,GB采用频率统计法。

检测设备

1. 核酸提取仪: KingFisher Flex型(通量96样本/次,提取效率≥95%)

2. PCR扩增仪: Bio-Rad CFX96型(温度精度±0.1°C,循环数40次)

3. 高通量测序仪: Illumina NovaSeq 6000型(通量20Tb/run,读长2x150bp)

4. 电泳系统: Agilent 4200 TapeStation(片段分析范围35-5000bp,分辨率1bp)

5. 分光光度计: NanoDrop One型(检测限0.2ng/μl,波长范围190-840nm)

6. 离心机: Eppendorf 5430R型(转速30,000rpm,控温范围-10-40°C)

7. 恒温培养箱: Memmert IN110型(温度范围5-80°C,稳定性±0.5°C)

8. 生物分析仪: Agilent 2100型(RNA/DNA完整性数RIN≥7.0,检测时间30min)

9. 液氮罐: Thermo Scientific CryoPlus型(储存温度-196°C,容量50L)

10. 超净工作台: Esco Airstream型(洁净度ISO 5级,风速0.45m/s)

11. 移液器: Eppendorf Research Plus型(精度±0.5%,体积范围0.1-1000μl)

12. 冰箱: Thermo Scientific TSX型(温度范围-86°C,温度波动±1°C)

13. 水浴锅: Julabo SW23型(控温精度±0.01°C,容量20L)

14. 显微镜: Olympus BX53型(放大倍数40-1000X,分辨率0.2μm)

15. 微阵列扫描仪: Agilent G2565CA型(扫描分辨率5μm,动态范围10^6)

北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).

CMA/CNAS等证书详情,因时间等不可抗拒因素会发生变更,请咨询在线工程师.

内容-荣誉资质

其他证书详情(可咨询在线工程师):

荣誉资质 国防经济发展促进会 AAA级信用证书

合作客户(部分)

1、自改制以来和政、企、军多方多次合作,并获得众多好评;

2、始终以"助力科学进步、推动社会发展"作为研究院纲领;

3、坚持科学发展道路,统筹实验建设与技术人才培养共同发展;

4、学习贯彻人大精神,努力发展自身科技实力。

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