检测项目
RNA提取与质量控制:
- RNA完整性检测:RIN值(≥7.0,参照Agilent2100标准)、浓度测定(ng/μl,精度±5%)
- 纯度分析:A260/A280比值(1.8-2.0)、A260/A230比值(≥2.0)
- 降解测试:28S/18S比值(≥1.5,参照Bioanalyzer协议)
文库构建测试:- 片段大小分布:峰值范围(200-500bp,偏差±10bp)
- 文库浓度:pM值(≥10nM,精度±0.1nM)
- 接头连接效率:PCR扩增循环数(≤15次,参照Illumina指南)
测序数据分析:- 序列比对率:映射率(≥90%,参照ENCODE标准)
- 读长质量:Q30分值(≥85%,Phred评分系统)
- 覆盖均匀度:变异系数(CV≤0.3)
差异表达基因鉴定:- 表达丰度计算:FPKM值(精度±0.01)
- 差异倍数:log2FC(阈值±1.0)
- 显著性检验:调整p值(≤0.05,Benjamini-Hochberg法)
功能富集分析:- 通路富集:KEGG通路p值(≤0.01)
- GO注释:富集因子(≥2.0)
- 基因集分析:FDR值(≤0.1)
可变剪切检测:- 外显子跳跃率:百分比(偏差±5%)
- 剪切位点支持:junctionreads数(≥10)
- 差异剪切事件:ΔPSI值(≥0.1)
融合基因分析:- 融合断点检测:支持reads数(≥5)
- 融合频率:FPKM比值(≥1.0)
- 功能预测:ORF完整性(参照RefSeq数据库)
SNP/Indel鉴定:- 变异位点频率:MAF值(≥0.05)
- 插入缺失长度:bp数(≤50bp)
- 质量过滤:GQ值(≥20)
表达定量验证:- qPCR确认:Ct值(精度±0.5)
- 相关性分析:R²值(≥0.8)
- 倍数一致性:foldchange偏差(≤0.5)
质量控制标准:- 批次效应校正:PCA距离(≤0.1)
- 样本间相似度:相关系数(≥0.9)
- 技术重复率:RSD值(≤10%)
检测范围
1.人类组织样本:涵盖肿瘤与正常组织配对样本,重点检测癌症相关差异表达基因和通路富集
2.动物模型样本:包括小鼠肝脏和脑组织,侧重代谢疾病模型的基因表达变化和功能验证
3.细胞培养样本:如HeLa细胞系,重点分析药物处理后转录组动态响应和细胞周期相关基因
4.植物样本:如水稻叶片,聚焦胁迫条件下(干旱、盐分)RNA表达差异和抗性基因鉴定
5.微生物样本:包括细菌培养物,重点检测抗生素处理下耐药基因表达变化和代谢通路
6.血液样本:如全血RNA,侧重免疫相关基因差异分析和炎症标志物检测
7.脑神经样本:如阿尔茨海默病模型,重点神经退行性变相关RNA表达谱和可变剪切事件
8.环境样本:如土壤微生物群落,聚焦环境污染物响应下的转录组多样性和功能基因
9.临床活检样本:如癌症患者FFPE组织,重点RNA提取优化和低丰度基因差异检测
10.发育阶段样本:如胚胎时间序列,侧重发育过程中基因表达动态变化和时序分析
检测方法
国际标准:
- ENCODERNA-seq分析流程:包括比对、定量和差异分析步骤
- ISO20395:2019生物技术-RNA测序质量控制要求
- Illumina测序协议:文库构建和测序运行规范
国家标准:- GB/T30988-2014高通量测序数据质量控制
- GB/T35538-2017转录组测序分析方法
- GB/T38576-2020人类转录组差异表达分析指南
方法差异说明:ENSEQ标准使用STAR比对工具而GB标准推荐HISAT2;ISO20395规定Q30阈值而GB/T30988要求Q20;Illumina协议针对特定平台优化而国标适应多平台兼容
检测设备
1.高通量测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量6Tb,读长2x150bp)
2.生物分析仪:Agilent2100Bioanalyzer(芯片类型RNA6000Nano)
3.分光光度计:NanoDropOne(检测范围2-15000ng/μl)
4.实时定量PCR仪:Bio-RadCFX96(温度精度±0.1°C)
5.高速离心机:Eppendorf5430R(最大RCF30,000xg)
6.电泳成像系统:Bio-RadChemiDocMP(灵敏度fg级)
7.超低温离心机:ThermoScientificSorvallLYNX(温度范围-20°C)
8.液氮存储系统:Taylor-WhartonCX100(容量100L)
9.自动化液体处理工作站:HamiltonMicrolabSTAR(通量96孔板)
10.倒置显微镜:OlympusIX73(放大倍数1000x)
11.恒温培养箱:MemmertIN110(温度范围5-70°C)
12.超低温冰箱:HaierDW-86L388(温度-86°C)
13.纯水净化系统:Milli-QAdvantageA10(电阻率18.2MΩ·cm)
14.振荡培养器:IKAKS4000(速度50-500rpm)
15.精密移液器:EppendorfResearchplus(精度±0.5%)
北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。
注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).
CMA/CNAS等证书详情,因时间等不可抗拒因素会发生变更,请咨询在线工程师.
合作客户(部分)
1、自创办以来和政、企、军多方多次合作,并获得众多好评;
2、始终以"助力科学进步、推动社会发展"作为研究院纲领;
3、坚持科学发展道路,统筹实验建设与技术人才培养共同发展;
4、学习贯彻人大精神,努力发展自身科技实力。