检测项目
分子标记检测:
- SSR分析:位点数量(≥10loci)、等位基因频率(0.1-0.9,参照ISSR标准)
- SNP分型:变异位点数量、最小等位基因频率(MAF≥0.05)
DNA序列分析:- 全基因组测序:覆盖率(≥30x)、序列一致性(≥99.8%)
- 靶向区域测序:插入缺失检测(INDEL≤5bp)、GC含量偏差(±10%)
表型性状测试:- 果实形态:果径变异系数(CV≤15%)、果皮厚度(0.5-2.0mm)
- 叶片特征:叶面积指数(LAI≥3.0)、叶柄长度(10-50mm)
群体遗传参数:- 杂合度计算:期望杂合度(He≥0.6)、观测杂合度(Ho)偏差(±0.1)
- 遗传距离测定:Nei's遗传距离(D≥0.05)、Fst统计量(Fst≤0.25)
亲缘关系分析:- 系谱重建:共祖系数(≥0.8)、亲子鉴定准确率(≥99%)
- 聚类分析:树状图分支支持率(bootstrap值≥70)
基因表达分析:- RNA-seq检测:差异表达基因数量(foldchange≥2)、FPKM值(≥1.0)
- qPCR验证:Ct值变异(CV≤5%)、扩增效率(90-110%)
染色体核型分析:- 核型参数:染色体数目(2n=34)、臂比指数(1.5-2.5)
- 异常检测:易位频率(≤0.1%)、缺失片段大小(≤10kb)
突变检测:- 点突变筛查:突变频率(≥0.01%)、错义突变比例(≤20%)
- 拷贝数变异:CNV区域长度(≥1kb)、拷贝数变化(foldchange≥1.5)
适应性测试:- 环境响应:胁迫耐受指数(≥80)、光合速率变异(±10%)
- 生长参数:株高年增量(50-100cm)、根系生物量(≥200g)
遗传资源评价:- 多样性指数:Shannon指数(I≥1.5)、Pielou均匀度(J≥0.7)
- 核心种质筛选:保留率(≥90%)、代表性阈值(≥0.8)
检测范围
1.苹果树种质资源:涵盖Malusdomestica品种,重点检测果实性状遗传变异和抗病基因关联
2.梨树种质资源:涉及Pyrus属资源,重点检测花器官形态多样性和低温适应性
3.桃树种质资源:Prunuspersica材料,重点检测果实成熟期遗传控制和品质参数
4.柑橘树种质资源:Citrus属样品,重点检测抗黄龙病基因型和精油成分变异
5.葡萄树种质资源:Vitisvinifera资源,重点检测糖酸比遗传基础和抗真菌性状
6.樱桃树种质资源:Prunusavium样本,重点检测开花时间同步性和果核大小遗传力
7.杏树种质资源:Armeniacavulgaris材料,重点检测休眠期调控基因和果实硬度
8.李树种质资源:Prunussalicina资源,重点检测自交不亲和性位点和产量稳定性
9.猕猴桃树种质资源:Actinidia属样品,重点检测维生素C含量遗传基础和藤蔓生长特性
10.橄榄树种质资源:Oleaeuropaea材料,重点检测油脂组分多态性和干旱胁迫响应
检测方法
国际标准:
- ISO21571:2005食品DNA提取和纯化通用方法
- ISO17025:2017检测实验室能力通用要求
- ISO20166-3:2018高通量测序数据分析规范
国家标准:- GB/T34797-2017植物遗传资源分子检测技术规范
- GB/T3543.5-1995农作物种子检验规程真实性鉴定
- GB/T18654.12-2008养殖鱼类种质检测遗传多样性分析
方法差异说明:国际标准ISO21571强调DNA提取缓冲液成分统一,而国家标准GB/T34797增加样本预处理步骤;ISO17025要求全程质量控制,GB/T18654.12针对特定物种优化参数。
检测设备
1.PCR扩增仪:Bio-RadT100(温度精度±0.1℃,升降温速率2.5℃/s)
2.DNA测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量1.5TB/run,读长2x150bp)
3.凝胶电泳系统:Bio-RadPowerPacHC(电压范围10-300V,电流上限400mA)
4.高速离心机:Eppendorf5430R(最大转速15000rpm,容量4x100ml)
5.紫外分光光度计:NanoDropOne(检测范围2-15000ng/μl,精度±1%)
6.荧光显微镜:OlympusBX53(分辨率0.2μm,荧光通道5个)
7.恒温培养箱:MemmertIN55(温度范围0-70℃,均匀度±0.5℃)
8.自动核酸提取仪:QiagenQIAcube(通量96样本/批次,提取效率≥95%)
9.实时荧光定量PCR仪:AppliedBiosystemsQuantStudio5(多色检测通道6个,动态范围10^7)
10.生物信息学工作站:DellPrecision7865(CPU核心128线程,内存1TB)
11.冷冻干燥机:ChristAlpha2-4(真空度0.001mbar,冷凝温度-80℃)
12.超低温冰箱:ThermoScientificTSX(温度-86℃,容量700L)
13.恒温摇床:Innova44(转速范围20-500rpm,温度控制5-80℃)
14.超纯水系统:Milli-QIQ7000(电阻率18.2MΩ·cm,产水速率2L/h)
15.电泳电源供应器:Bio-RadPowerPacBasic(输出电压300V,电流400mA)
北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。
注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).
CMA/CNAS等证书详情,因时间等不可抗拒因素会发生变更,请咨询在线工程师.
合作客户(部分)
1、自创办以来和政、企、军多方多次合作,并获得众多好评;
2、始终以"助力科学进步、推动社会发展"作为研究院纲领;
3、坚持科学发展道路,统筹实验建设与技术人才培养共同发展;
4、学习贯彻人大精神,努力发展自身科技实力。