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药物基因组学关联性分析

原创
发布时间:2025-07-25 14:14:56
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检测项目

基因变异检测:

  • CYP2D6分型:*3/*4/*5等位基因变异检出限(≥0.1%频率,参照PharmGKB)
  • VKORC1分型:rs9923231SNP检测(基因型CC/CT/TT,参照CPIC指南)
  • TPMT分型:*2/*3A/*3C等位基因(检测灵敏度≥99%)
代谢酶功能分析:
  • CYP2C19代谢表型:超快代谢者(*17/*17)、中间代谢者(1/2)
  • DPYD活性评分:酶活性降低风险(评分≥2,参照EMA指南)
  • UGT1A128变异:胆红素升高关联性(TA重复≥7次)
药物转运体检测:
  • ABCB1分型:rs1045642SNP(CC/CT/TT基因型)
  • SLCO1B1分型:rs4149056变异(T>C等位基因频率)
药物靶点变异:
  • EGFR突变:L858R/T790M检测(灵敏度≥95%)
  • HER2扩增:拷贝数变异(CNV≥2.0,参照ASCO标准)
表型关联分析:
  • 药物响应曲线:EC50值计算(p<0.05显著性)
  • 不良反应风险:皮疹发生率关联(OR≥2.0)
剂量优化模型:
  • 华法林剂量算法:基于VKORC1/CYP2C9的剂量预测(误差±10%)
  • 氯吡格雷调整:CYP2C19依赖剂量(增量≥50mg)
人群遗传结构:
  • 祖先成分分析:主成分PC1-PC3(方差解释≥70%)
  • 连锁不平衡检测:D'值≥0.8
统计建模:
  • 逻辑回归:OR值计算(95%CI)
  • 生存分析:HR值测试(Cox模型)
临床验证:
  • 敏感性/特异性:AUC≥0.8
  • 阳性预测值:PPV≥80%
多基因风险测试:
  • PRS评分:多基因风险分数(范围0-1)
  • 基因-环境交互:吸烟交互效应(p<0.01)

检测范围

1.心血管药物:华法林、氯吡格雷等,重点检测VKORC1和CYP2C9变异对凝血时间的影响

2.抗癌药物:5-氟尿嘧啶、伊立替康等,侧重DPYD和UGT1A1变异导致的毒性风险测试

3.精神科药物:选择性血清素再摄取抑制剂(SSRIs),核心检测CYP2D6代谢表型与疗效关联

4.免疫抑制剂:硫唑嘌呤、他克莫司等,针对TPMT和CYP3A5变异优化剂量以避免骨髓抑制

5.镇痛药物:可待因、曲马多等,重点分析CYP2D6超快代谢者导致的吗啡转化风险

6.抗感染药物:抗HIV药物如依法韦仑,检测CYP2B6变异与中枢神经系统副作用

7.内分泌药物:他莫昔芬等,核心测试CYP2D6表型与复发率关联

8.呼吸系统药物:β2-激动剂如沙丁胺醇,侧重ADRB2基因变异与支气管扩张响应

9.消化系统药物:质子泵抑制剂如奥美拉唑,检测CYP2C19代谢状态与疗效持续时间

10.神经科药物:抗癫痫药如卡马西平,重点分析HLA-B1502变异与Stevens-Johnson综合征风险

检测方法

国际标准:

  • CPICGuidelines2023基因-药物剂量推荐
  • FDATableofPharmacogeneticAssociations基因变异临床关联验证
  • ISO15189:2022医学实验室基因检测质量要求
  • PharmGKBAnnotationLevels证据等级分级
国家标准:
  • GB/T30987-2022高通量测序在药物基因组学中的应用
  • 中国药典2020版基因检测指导原则
  • YY/T1642-2019体外诊断试剂基因分型性能评价
  • GB/T35944-2018药物代谢酶基因多态性检测方法
(方法差异说明:国际标准如CPIC强调临床可操作性,而国家标准如GB/T30987侧重技术参数;基因芯片法通量高但分辨率有限,NGS法覆盖全面但需生物信息学校验。)

检测设备

1.实时荧光定量PCR仪:ABIQuantStudio7Pro型(检测通道数≥6,灵敏度达0.1%变异)

2.高通量测序仪:IlluminaNovaSeq6000型(通量≥6Tb/run,读取长度2x150bp)

3.基因芯片扫描仪:AffymetrixGeneTitan系统(位点密度≥1M,自动化程度高)

4.质谱分析仪:WatersXevoTQ-S型(质量精度≤2ppm,动态范围宽)

5.核酸提取工作站:QIACubeHT型(通量≥96样本/批次,回收率≥95%)

6.荧光显微镜:OlympusBX53型(分辨率≤0.2μm,适用FISH检测)

7.生物分析仪:Agilent4200TapeStation系统(DNA/RNA完整性数≥8.0)

8.恒温扩增仪:Bio-RadCFX96型(温控精度±0.1°C,循环时间短)

9.电泳系统:Bio-RadCHEF-DRIII型(电压范围50-200V,分离效率高)

10.流式细胞仪:BDFACSymphonyA5型(检测参数≥50,速度≤10000事件/秒)

11.微滴数字PCR仪:Bio-RadQX200型(绝对定量精度CV≤5%)

12.自动化液体处理系统:HamiltonSTARlet型(移液精度±1%,通量可扩展)

13.生物信息服务器:DellPowerEdgeR750型(CPU核心≥64,内存≥512GB)

14.低温存储柜:ThermoScientificTSX系列(温度范围-86°C,稳定性±1°C)

15.超微量分光光度计:NanoDropOne型(样本量≥0.5μL,检测波长200-850nm)

北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).

CMA/CNAS等证书详情,因时间等不可抗拒因素会发生变更,请咨询在线工程师.

合作客户(部分)

1、自创办以来和政、企、军多方多次合作,并获得众多好评;

2、始终以"助力科学进步、推动社会发展"作为研究院纲领;

3、坚持科学发展道路,统筹实验建设与技术人才培养共同发展;

4、学习贯彻人大精神,努力发展自身科技实力。

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