检测项目
微生物群落组成分析:
- 细菌丰度分布:相对丰度≥0.01%、优势菌属占比(参照QIIME2流程)
- 真菌分类群鉴定:属级分辨率、子囊菌门比例≥5%
- 古菌多样性:甲烷菌丰度(Methanobrevibacterspp.计数)
多样性指数计算:- 香农多样性指数:H'值范围1.0-5.0(参照Shannon公式)
- 辛普森多样性指数:1-D值≥0.8、均匀度指数E≥0.7
- 系统发育多样性:PD值(参照Faith'sPD)
功能基因检测:- 抗生素抗性基因:ARGs丰度(如tetA、blaCTX-M,检出限0.001copies/μL)
- 代谢通路预测:KEGG通路丰度(如碳水化合物代谢≥10%)
- 氮循环基因:amoA、nirK基因计数(参照MetaCyc数据库)
病原微生物筛查:- 肠道病原菌检测:沙门氏菌属丰度、大肠杆菌O157:H7(检出限10CFU/g)
- 病毒筛查:轮状病毒、诺如病毒(Ct值≤35)
- 寄生虫鉴定:隐孢子虫卵囊计数(参照ISO18744)
抗生素抗性分析:- 多重抗性基因:MGEs丰度(如整合子intI1)
- 抗性表型关联:MIC值测定(如氨苄西林≥32μg/mL)
- 抗性传播风险:水平基因转移频率(参照CARD数据库)
丰度分布测试:- 核心微生物群:丰度稳定性(CV≤15%)
- 稀有物种检测:OTUs数≥1000(参照97%相似度)
- 季节变化分析:丰度波动率≤20%
群落结构比较:- β多样性分析:Bray-Curtis距离(参照PCoA)
- 相似度聚类:ANOSIMR值≥0.5
- 差异物种鉴定:LEfSeLDAscore≥3.0
环境因子关联:- 饲料影响检测:普氏菌属丰度与粗纤维关联(R²≥0.6)
- 温度响应:微生物活性变化(Q10值1.5-2.5)
- pH相关性:放线菌门比例(pH6.0-8.0)
系统发育分析:- 进化树构建:NJ树bootstrap值≥70
- 分类单元鉴定:LTP数据库匹配度≥95%
- 祖先状态重建:ML算法(参照RAxML)
代谢功能预测:- 酶活性测试:CAZy家族丰度(如GHs≥5%)
- 短链脂肪酸:乙酸产量≥10mM(参照GC-MS)
- 能量代谢基因:atpD、sdhA计数
检测范围
1.猪粪便样本:涵盖育肥猪和母猪粪便,重点检测肠道病原菌(如沙门氏菌)丰度和益生菌(如乳酸杆菌)平衡,测试抗生素使用影响。
2.牛粪便样本:包括奶牛和肉牛粪便,侧重瘤胃微生物多样性(如纤维降解菌)和甲烷产生菌(甲烷杆菌属)分析,监测温室气体排放关联。
3.禽类粪便样本:涉及鸡、鸭等家禽粪便,关注沙门氏菌、弯曲杆菌等食源性病原体筛查,以及抗性基因传播风险。
4.宠物粪便样本:包含犬、猫粪便,检测人畜共患病微生物(如弓形虫、贾第鞭毛虫)和肠道菌群健康指数。
5.野生动物粪便样本:如鹿、熊粪便,研究自然生态微生物组成,重点分析稀有物种(如放线菌)和环境适应机制。
6.发酵动物粪便样本:堆肥或沼气发酵粪便,测试降解微生物(如芽孢杆菌)群落变化和功能基因(纤维素酶)丰度。
7.水产动物粪便样本:包括鱼、虾粪便,检测水质污染指示菌(如大肠杆菌)和抗生素残留关联微生物。
8.实验室模拟粪便样本:人工合成粪便基质,用于方法验证和标准曲线建立,侧重重复性和检出限。
9.历史粪便样本:考古或冻存标本,分析古微生物组成(如芽孢杆菌孢子)和进化研究。
10.实验动物粪便样本:如小鼠、大鼠粪便,在可控条件下检测微生物干预效果,关注多样性指数和代谢通路。
检测方法
国际标准:
- ISO16140-2:2016微生物分子检测方法(强调高通量测序和qPCR)
- ISO18744:2015寄生虫卵囊检测(采用显微镜和PCR确认)
- ISO21528-2:2017肠杆菌科定量(基于培养和测序)
国家标准:- GB/T38502-2020动物粪便微生物检测方法(侧重16SrRNA测序和培养法)
- GB/T4789.31-2020食品微生物分子检测(适用于粪便病原菌筛查)
- GB/T33682-2017微生物多样性分析(使用OTU聚类和指数计算)
(国际标准如ISO16140-2优先高通量技术,国标GB/T38502-2020整合传统培养法差异;ISO方法通量高但设备要求严,国标更易普及但灵敏度略低)
检测设备
1.高通量测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量最高20Gb,读长2x150bp)
2.实时荧光定量PCR仪:Bio-RadCFX96(温度精度±0.1℃,通道数6)
3.显微镜:OlympusBX53(放大倍数1000x,分辨率0.2μm)
4.离心机:Eppendorf5430R(转速15000rpm,容量50mL)
5.核酸提取仪:QIAGENQiaCube(通量24样本/批,回收率≥95%)
6.凝胶成像系统:Bio-RadChemiDoc(灵敏度0.1ngDNA,UV透射)
7.恒温培养箱:MemmertIN110(温度范围4-60℃,精度±0.5℃)
8.气相色谱质谱联用仪:Agilent8890/5977B(检测限0.1ppm,扫描速度20Hz)
9.生物分析仪:Agilent2100(DNA/RNA完整性数≥7)
10.超低温冰箱:ThermoScientificTSX(温度-80℃,容量700L)
11.厌氧培养系统:DonWhitleyDG250(O₂浓度≤0.1%,CO₂控制)
12.酶标仪:TecanInfiniteM200(波长范围230-1000nm,精度±1%)
13.超声波破碎仪:Scientz-IID(功率650W,频率20kHz)
14.纯水系统:MilliporeMilli-Q(电阻率18.2MΩ·cm)
15.生物安全柜:EscoAirstream(洁净度Class100,风速0.5m/s)
北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。
注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).
CMA/CNAS等证书详情,因时间等不可抗拒因素会发生变更,请咨询在线工程师.
合作客户(部分)
1、自创办以来和政、企、军多方多次合作,并获得众多好评;
2、始终以"助力科学进步、推动社会发展"作为研究院纲领;
3、坚持科学发展道路,统筹实验建设与技术人才培养共同发展;
4、学习贯彻人大精神,努力发展自身科技实力。